Students of Jiří Kléma
PhD theses:
| 2023/24 | Vladimír Kunc | Gene Expression Inference Using Artificial Neural Networks |
| 2021/22 | František Malinka | Semantic Biclustering |
| 2008/09 | Filip Karel | Quantitative Association Rule Mining |
Diploma theses:
| 2023/24 | Matouš Soldát | Protein engineering with large language models |
| 2023/24 | Lucie Muhlfeitová | Automated annotation of non-coding RNAs |
| 2023/24 | Barbora Mašková | Explainable and transferable fungal intron models |
| 2022/23 | Alikhan Anuarbekov | Inference of interaction networks from multi-omics data using Bayesian networks |
| 2020/21 | Martin Indra | Automatic Intron Detection in Metagenomes Using Neural Networks |
| 2019/20 | Evžen Šírek | Robust cell subsets decomposition from tissue expression profiles for biomarker identification |
| 2018/19 | Denis Baručić | Automatic intron detection in fungal genomes using machine learning |
| 2018/19 | Marek Hrvol | Efficient similarity calculation for RNA secondary structures |
| 2018/19 | Anh Vu Le | Secondary structure search in primary nucleic acid structures (Dean's Award) |
| 2018/19 | Marek Zvara | Automatic intron detection in fungal genomes using probabilistic models |
| 2015/16 | Filip Mihalovič | Distributed cloud-based approaches to the genomic data analysis |
| 2014/15 | Sebastian Skoupý | Knowledge discovery in large temporal data |
| 2014/15 | Mukhiddin Yusupov | Utilization of methylation data in phenotype molecular models |
| 2013/14 | Valentin Gologuzov | miXGENE – a web tool for integrative analysis of genomic data |
| 2012/13 | Jan Zahálka | mRNA and miRNA Data Integration for Accurate Molecular Classification |
| 2011/12 | Michael Anděl | Feature Extraction for Gene Expression Data Analysis |
| 2010/11 | Hynek Urban | Bayesian Haplotype Frequency Prediction (Dean's Award) |
| 2010/11 | Petr Janský | Working flexizone utilization prediction |
| 2009/10 | Přemysl Vítovec | Gene Interaction Extraction from Biomedical Texts |
| 2007/08 | Miloš Krejník | Předzpracování a klasifikace genomických dat |
| 2005/06 | David Kaisner | Dolování biomedicínských dat |
| 2005/06 | Tomáš Holas | Vyhledávání přibližných závislostí v relačních datech |
| 2005/06 | Petr Buryan | Predikce časových řad -- statistické metody a strojové učení (RWE Transgas Award) |
| 2004/05 | Martin Vejmelka | Problém predikce epileptických záchvatů z EEG záznamů (Dean's Award) |
| 2004/05 | Filip Karel | Ordinální asociační pravidla (Dean's Award) |
| 2003/04 | Václav Bláha | Metody strojového učení ve zpracování lékařských dat |
| 2002/03 | Marcel Kičmer | Dobývání znalostí z lékařských dat |
| 2002/03 | Roman Bošek | Využití metod strojového učení v prediktivních úlohách |
Bachelor theses:
| 2021/22 | Martin Miadok | Hierarchical multi-label classification for automated protein function prediction |
| 2020/21 | Karina Balagazova | Adjustment for the confounding factor influence in the RNASeq data classification |
| 2017/18 | Petr Kubelka | Semantic Biclustering Optimization |
| 2016/17 | Tomas Kala | Event detection from text data (Dean's Award) |
| 2014/15 | Filip Masri | Feature network regularized SVM omics classifier |
| 2014/15 | Vladimír Kunc | Increasing weak classifier diversity in ensemble models by feature graphs (Dean's Award) |
| 2012/13 | Filip Mihalovič | Analysis and sequential mining of logistic data |
| 2009/10 | Libor Bukata | Deskripce a klasifikace vícerozměrných časových řad |
| 2009/10 | Jakub Bureš | Moduly v metabolických a signálních drahách |
| 2009/10 | Jan Motl | Znalostní molekulární klasifikátory |
| 2008/09 | Hynek Urban | Knowledge-Oriented Genomic Probeset Consolidation |
| 2008/09 | Tomáš Sixta | Knowledge-Oriented Gene Expression Data Processing |
| 2007/08 | Tomáš Bílek | Predikce časové řady inteligentním adaptivním systémem |
| 2006/07 | Michal Trna | Klasifikace s apriorní znalostí |
The last change: